等到火焰熄灭，人们才意识到自己失去了什么。这个可怕的狂热份子让他们摧毁了最珍爱的东西。他们转而开始对抗萨沃那罗拉，他被扔进了监狱，受到了酷刑折磨，可是他对自己的所作所为好不后悔。他是个诚实的人，一心想要过圣洁的生活。他就是想要摧毁那些存心与他观点相左的人。只要看到有邪恶，就要根除邪恶，他视之为己任。他是教会虔诚的儿子，在他眼里，爱上了异教徒的书，爱上了异教徒的美丽，那就是邪恶。可是他孤立无援，他在为一个死去的过去的时代而战。罗马的教皇可以救他，可是教皇连手指都不愿动一动。相反，他赞同“忠诚的佛罗伦萨人”的行为，佛罗伦萨人把萨沃那罗拉拖到了绞刑架上，他被吊死了，快乐的人群又叫又闹地焚烧了他的尸体。
虽然很悲惨，但这是必然的结局。如果放在11世纪，萨沃那罗拉就会是个伟人。可是到了15世纪，他领导的就是败局已定的事业。好也罢，坏也罢，教皇都成为了人文主义者，梵蒂冈成了罗马和希腊古物最重要的博物馆，这时中世纪就结束了。